一项研究综合分析了来自世界各地559例食管癌和胃癌患者的样本，表明了食管癌主要有两种类型，并且它们在分子特征上有显着性的差异，所以将食管癌列为特殊性的疾病。
此项研究来自癌症基因组图谱的研究网络，并且发表在《自然》杂志上。研究包括两个关键的内容：第一，位于食管上端发生的癌症与头颈癌相似，然而随着食管癌的向下蔓延，所表现的症状与某些亚型的胃癌几乎相同。第二，癌症临床试验应根据分子亚型症状将患者分组，将下食管癌与胃癌分组，同时还需要单独列出上食管癌。达加法伯癌症研究所的食管癌研究与医师科学家联合领导人亚历克斯•巴斯说：“这些研究结果为我们目前对食管癌基因组学的研究提供了深层次的理解。我们希望这项工作可以解决食管癌领域的一些长期不确定因素，并为研究人员和药物开发者寻求更有效的临床试验和新的治疗方法的奠定基础。
十几年来，医生都知道，当把食管癌细胞放到显微镜下观察，会出现两种结构，一种是类似于胃癌或直肠癌细胞一样的腺癌细胞的形状，另外一种是类似肺、皮肤和头颈部细胞的鳞状癌细胞。目前，人们尚未了解腺食管癌和鳞状食管癌的分化程度以及腺食管癌和胃腺癌之间的关系。
国际癌症基因组谱图的首席研究员兼温安洛研究所的教授彼得•莱尔德博士说：“我们的研究表明了这种临床亚型的癌症在分子水平上有很大差异，食管癌的肿瘤细胞是来自食道还是胃部与人体内个体肿瘤的分子特征无关。”
这项新的报道反对研究人员将食管癌和胃腺癌进行分开，他们认为应该将食管癌和胃癌视为和直肠癌一样的实体。该项研究表明食管癌与胃癌在分子结构上相似，而胃癌被是染色体不稳定的一类肿瘤，所以，将食管癌标志位染色体结构畸变。一些肿瘤学家也表示，这种细微的疾病观点，即食管癌细胞的分子结构的详细分析，可能会改变他们的研究方向和治疗方法。
但是，来自斯隆•凯特琳癌症中心的胃肠肿瘤学家耶尔纳•扬吉吉安说：“从癌症基因组谱图的数据可以看出，食道鳞状上皮癌和食管腺癌是完全不同的疾病，不应该被纳入一个治疗试验中，在食管癌的治疗过程中，合适的治疗手段和治疗策略的结合可以有助于食管癌的治疗，这项治疗都会在后续的研究中进行讨论。”
虽然在美国食管癌仅占新癌症诊断病例的1%，但是，病人在诊断的五年之类，就有五分之四的人会死去，目前的治疗方法根本不能治愈这种疾病。除此之外，食管癌的病例在过去的四十年内持续上升，与七十年代中期相比，已经增加了七倍。
国际癌症基因组谱图研究网络的首席研究员和系统生物学研究所的教授伊利亚•什穆列维奇博士说：“基因组图谱的研究超越了任何一个机构或个人的工作，但是这些巨大的事业只有通过世界各地数以百计的专家和科学家的贡献才能够实现，他们将自己的生命献给这些项目，希望能够为食管癌病人找到新的治疗方法，治疗食管癌病人的疾病。”
